С вступлением в силу Люневильского мира и окончанием Второй коалиционной войны граница Империи с Францией была окончательно определена по Рейну, что для ряда германских княжеств означало потерю территорий; при этом договором была предусмотрена компенсация за эти земли, а именно: путём проведения секуляризации духовных княжеств в Германии. Баден, стремившийся в это время проводить по возможности нейтральную политику, а фактически союзную Наполеону, который, в свою очередь, стремился создать в южной Германии блок буферных государств (Баден, Вюртемберг и Бавария), стал одним из наиболее выигравших в этом процессе перемен. На руку Бадену сыграло и внезапное ослабление Курпфальца, объединённого с Баварией.
Оформление Рейнского союза в 1806 году зафиксировало не только ситуацию французской гегемонии в Германии, но и выход Бадена из состава империи, что послужило прологом к произошедшему несколько позже отречению Франца II. В этом смысле титул курфюрста, и до того формальный, терял своё значение, и южногерманские государства были реорганизованы. Баденский курфюрст Карл Фридрих хоть и не получил от Наполеона королевский титул, как произошло с его вюртембергским и баварским «коллегами», а «всего лишь» великогерцогский, довольствовался дальнейшими территориальными приобретениями за счёт княжеств Фюрстенберг, Ляйнинген и Лёвенштайн-Вертхайм с общим населением более 300 000 человек.
Maria Schimke (Hrsg.): Regierungsakten des Kurfürstentums und Großherzogtums Baden 1803—1815. Quellen zu den Reformen in den Rheinbundstaaten, Bd. 8. München: Oldenbourg Wissenschaftsverlag 2011, ISBN 978-3-486-58677-0