Республіка утворена в результаті вступу в січні1795 року на територію Нідерландів французьких республіканських військ і повстання (січень — березень 1795) місцевого населення. Названа за іменем племені батавів, що заселяли в давнину територію Нідерландів.
Вступ Батавської республіки в травні 1795 в військово-політичний союз з Францією поклав початок залежності держави від Франції і зумовив її участь у війнах Франції проти антифранцузької коаліції.
Для внутрішньополітичного розвитку Батавської республіки була характерна гостра боротьба дрібних та середніх купців і промисловців за підтримки народних мас проти засилля великих торговців і фінансової олігархії. Проект конституції Батавії, підготовлений скликаними 1 березня1796 року Національними зборами, в яких переважали представники великого бюргерства, був відкинутий переважною більшістю населення. Отримавши перевагу на наступних виборах (січень 1798), радикальні елементи усунули від влади консерваторів і запропонували конституцію (1798), відповідно до якої були ліквідовані залишки феодалізму в країні.
Реакційний переворот, здійснений в червні 1798 року, завадив проведенню в життя демократичних прав і свобод, проголошених цією конституцією. В 1801 році Батавії була нав'язана нова конституція, що скасувала всі демократичні завоювання. 1805 року за наполяганням Наполеона I на чолі Батавії було поставлено так званого «великого пенсіонарія» Р. Я. Схіммелпеннінка, що володів диктаторськими повноваженнями.
У травні — червні 1806 Наполеон перетворив Батавію у Голландське королівство (існувало в 1806—1810 роки), проголосивши королем свого брата Луї (Людовика) Бонапарта.
